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Deutsch-Wagram war schon vor dem 16. Jahrhundert eine Pfarrgemeinde. Sie war eine Filiale von Kagran. Aufgrund der großen Entfernung kam sie im Jahre 1640 zur Pfarre Gerasdorf. Seit 22. März 1784 ist Deutsch-Wagram eine eigene Pfarre.
1956 bis 1958 wurde die Kirche in der derzeitigen Form umgebaut.
Wann die alte Kirche gebaut wurde, weiß man nicht. Die einzig auffindbare Jahreszahl war am Turm zu lesen: 1750. Sie stammte von einer Renovierung.
